Actualités JVTech Une future pandémie ? Cette étude révèle qu’une nouvelle bactérie mutante et invulnérable prolifère sur l’ISS
Publié le 27/04/2024 à 15h15
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Les bactéries et les virus sont toujours venus sous nos pieds et, si nous regardions plutôt au-dessus de nos têtes, à 400 km de là. C’est en effet l’ISS qui suscite aujourd’hui des interrogations avec une bactérie unique.
Une bactérie unique à l’intérieur de l’ISS
Faire des expériences dans l’espace est un rêve devenu réalité grâce à la Station spatiale internationale (ISS). Malgré son environnement hautement contrôlé, caractérisé par la microgravité, des niveaux accrus de CO2 et un rayonnement solaire intense, les micro-organismes occupent une niche unique. Ces habitants microbiens jouent un rôle important dans la santé et le bien-être des astronautes à bord. Parmi elles, une bactérie suscite un intérêt particulier : Enterobacter bugandensis. Principalement présent dans les échantillons cliniques, y compris l’intestin grêle humainon lui attribue également des caractéristiques pathogènes, qui peuvent conduire à une multitude d’infections.
Contrairement à leurs homologues terrestres, les souches d’Enterobacter bugandensis présentes sur l’ISS ont développé des mécanismes de résistance qui les classent dans le groupe pathogène ESKAPE, reconnu pour sa redoutable résistance aux traitements antimicrobiens. Au cours de la mission de surveillance microbienne MT-1 de deux ans, 13 souches d’E. bugandensis multirésistantes ont été isolées à partir de divers endroits de l’ISS. Une étude approfondie a été menée pour comprendre les subtilités génomiques de la souche présente à bord de l’ISS par rapport aux souches présentes sur Terre.en se concentrant particulièrement sur ceux associés aux infections cliniques.
L’étude
révèle les trajectoires évolutives de gènes clés, contribuant notamment aux adaptations et à la potentielle résistance aux antimicrobiens. L’hypothèse centrale de cette étude était que les contraintes de l’environnement spatial, distinctes de celles rencontrées sur Terre, pourraient être à l’origine de ces adaptations génomiques.
Une vraie différence par rapport aux variétés terrestres
À partir de la base de données publique GenBank du Centre national d’information sur la biotechnologie, 211 génomes identifiés comme E. bugandensis ont été obtenus et analysés. Parmi eux, 12 provenaient de trois endroits différents à bord de l’ISS lors du premier vol de la mission MT-1 : quatre de la zone de contrôle aérien (AC), un du simulateur d’exercices avancé à résistance variable et sept du compartiment déchets et hygiène. .
Une comparaison approfondie des génomes entiers a révélé que les souches de l’ISS constituent un groupe distinct de celles trouvées dans d’autres environnements et hôtes terrestres. En particulier, une souche, AR1358, provenant de l’hôpital Sir Run Run Shaw du Zhejiang, en Chine, regroupés en étroite collaboration avec les isolats ISS dans tous les arbres phylogénétiques. Alors une potentielle contamination déjà sur Terre ?
Les chercheurs ont également observé des variations génétiques significatives entre les souches de l’ISS et leur homologue terrestre le plus proche, AR1358. Ces variations comprenaient des milliers de mutations ponctuelles uniques et d’autres types de changements génétiques. Ces résultats suggèrent que les souches d’E. bugandensis de l’ISS présentent des différences génétiques notables par rapport à leurs homologues terrestres.
L’analyse a permis d’identifier et d’annoter chacun des 211 génomes/MAG. Cette analyse a révélé un large ensemble de gènes codant pour des protéines, y compris des nombres relativement plus élevés dans des catégories telles que le transport et le métabolisme des acides aminés et les facteurs de transcription dans les souches ISS. Ce qui pourrait expliquer leur plus grande résistance.
