Impact du Covid sur la surveillance épidémiologique

Impact du Covid sur la surveillance épidémiologique
Impact du Covid sur la surveillance épidémiologique

SI-DEP, VAC-SI, Surv-ESMS… Ces acronymes ont ponctué les publications pendant la pandémie. Covid La maladie à coronavirus, parfois appelée maladie à coronavirus, est une maladie causée par un coronavirus (CoV). Le terme peut désigner les maladies suivantes : syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) provoqué par le virus SARS-CoV, syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) provoqué par le virus MERS-CoV, maladie à coronavirus 2019 (Covid-19) provoquée par le Virus SRAS-CoV-2. 19. Santé publique consacre BEH du 5 novembre 2024 à « Les systèmes d’information face à la pandémie de Covid-19 : enjeux et héritages majeurs », un numéro important d’une cinquantaine de pages qui relate la mise en œuvre des systèmes ou leur adaptation dans l’urgence sanitaire, pour guider les décideurs et mettre en œuvre la stratégie « tester, alerter, protéger » et ralentir la propagation du virus. Un document de référence pour tous ceux qui s’intéressent aux systèmes de veille des alertes sanitaires et à leur impact sur la population et le système de santé.

« Plusieurs défis majeurs ont dû être relevés : 1) collecter et analyser de grandes quantités de données quasi exhaustives pour décrire la circulation virale à l’échelle territoriale ; 2) fournir des indicateurs fiables et mis à jour quotidiennement, dans le but de permettre une prise de décision rapide et éclairée ; 3) intégrer une vision longitudinale des données», peut-on lire dans l’éditorial de ce numéro, signé par Laëtitia Huiart, qui a été directrice scientifique de Santé publique France d’octobre 2020 à août 2024, et Caroline Alleaume, responsable à l’agence.

Volume de données à traiter, transparence, interconnexion entre systèmes d’information, pseudonymisation… Les enjeux liés à la création à partir de rien les outils sont explorés dans le BEH. Ainsi, SI-DEP, le système d’information de dépistage de la population, a été mis en place le 13 mai 2020 de manière réactive, soit deux mois après la mise à disposition des tests, pour recevoir automatiquement tous les résultats des tests (PCR, antigéniques) réalisés quotidiennement par tous les laboratoires publics et privés, ainsi que les professionnels de santé habilités (principaux France et DOM)…

Si-DEP, Système d’information de dépistage de population

Ex nihilo ou dispositifs adaptés

VAC-SI, le système d’information issu du Vaccin Covid, constituant la base de données des vaccinations contre COVID-19[feminine La maladie à coronavirus, parfois appelée maladie à coronavirus, est une maladie causée par un coronavirus (CoV). Le terme peut désigner les maladies suivantes : syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) provoqué par le virus SARS-CoV, syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) provoqué par le virus MERS-CoV, maladie à coronavirus 2019 (Covid-19) provoquée par le Virus SRAS-CoV-2. a également été créé rapidement, mais a connu plusieurs évolutions pour prendre en compte les lieux de résidence, suivre les vaccinations des professionnels de santé et des résidents des Ehpad… tout en gérant l’appariement avec les bases de données SI-DEP et SI-VIC. SI-VIC est un système déclenché pour des situations exceptionnelles. Créé en 2015 dans le contexte des attentats islamistes pour assurer l’identification et le comptage des victimes, donner une visibilité sur l’impact de l’événement sur la prise en charge et faciliter l’accompagnement des victimes et de leurs proches, le SI-VIC s’est enrichi d’offres individuelles et médicales. des données pour assurer un suivi en temps réel des hospitalisations liées au Covid à l’heure où la saturation des capacités hospitalières constituait un indicateur majeur pour la gestion de la pandémie.

Autre système d’information créé au lendemain de la canicule de 2003 – où les urgences et les services funéraires étaient saturés – SurSaUD® (Surveillance Syndromique des Urgences et des Décès), transmet quotidiennement de manière automatisée, sans sélection, des informations sur le recours aux urgences (Oscour), SOS médecins (SOSM) et décès. Il a fallu ajouter de nouveaux codes à ceux existants caractérisant les recours Covid et les diffuser dans l’ensemble du dispositif d’urgence pour assurer un traitement homogène et fiable des recours Covid. Ainsi, 722 services d’urgence, 62 associations de médecins SOS, 15 062 communes et 1 400 hôpitaux documentent SurSaUD.

Nouveaux outils

Les établissements médico-sociaux, au premier rang desquels les Ehpad, ont été dramatiquement impactés par le Covid. Il n’existait pas de système d’information épidémiologique pour ces établissements. Surv-ESMS a été mis en place dans tous ces établissements comprenant des hébergements, pour suivre la situation des personnes hébergées et du personnel et produire des indicateurs quotidiens des crises et des décès du Covid. Cette mise en place en mars 2020 et son adaptation progressive ont constitué un défi dans des établissements mal équipés et mal formés aux outils informatiques nécessaires à un tel système.

Pour s’approcher de l’exhaustivité et de la représentativité des informations obtenues en temps réel, il s’agit désormais de tester la fiabilité des indicateurs issus des systèmes d’information. Orchid (Organisation d’un réseau de centres hospitaliers impliqués dans la surveillance épidémiologique et la réponse aux épidémies) va « tester la production réactive d’indicateurs spécifiques à partir des entrepôts de données de santé des établissements hospitaliers ».

« Notre capacité à capitaliser sur les systèmes d’information déployés pendant la crise du Covid-19 est cruciale pour moderniser plus généralement nos systèmes de surveillance courante », conclut l’éditorial. Car la pandémie, qui a également révélé des impacts sociaux différenciés et des impacts à long terme, notamment sur la santé mentale, suggère la nécessité de systèmes de surveillance plus inclusifs et interconnectés pour anticiper les futures crises de santé publique dans une perspective « individuelle ». seulement la santé.

 
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