Bactéries éditées in vivo chez la souris – .

Bactéries éditées in vivo chez la souris – .
Bactéries éditées in vivo chez la souris – .

Des scientifiques ont conçu un outil d’édition génétique capable de modifier les populations bactériennes du microbiome intestinal de souris vivantes. Ils ont publié leurs travaux dans la revue Nature [1].

L’outil, un type d’éditeur de base (voir MOBE : un outil permettant d’effectuer des éditions de base simultanées), a modifié le gène cible dans plus de 90 % d’une colonie deEscherichia coli à l’intérieur de l’intestin de la souris » sans que le gène modifié ne produise des copies potentiellement nocives de lui-même « Un effet obtenu environ huit heures après le traitement. » Nous avons rêvé de pouvoir faire ça ” a déclaré Xavier Duportet, biologiste et co-fondateur de la société Sortie Bioscienceune société de biotechnologie à Paris.

Concevoir un nouveau vecteur

Jusqu’à présent, les éditeurs de base n’étaient pas parvenus à modifier suffisamment la population bactérienne cible pour être efficaces. En effet, les vecteurs utilisaient uniquement des récepteurs ciblés communs aux bactéries cultivées en laboratoire.

Xavier Duportet et ses collègues ont développé un vecteur utilisant des composants d’un bactériophage – un virus qui infecte les bactéries – pour cibler plusieurs récepteursE. coli qui sont exprimés dans l’environnement intestinal. Les chercheurs ont également affiné le système pour empêcher la réplication et la propagation des gènes modifiés.

Un éditeur adapté

Les chercheurs ont ensuite adapté l’éditeur de base afin qu’il puisse modifier un gèneE. coli qui produit une protéine qui jouerait un rôle dans plusieurs maladies neurodégénératives et auto-immunes. La proportion de bactéries modifiées était d’environ 70 % trois semaines après le traitement des souris. En laboratoire, les scientifiques ont également pu utiliser l’outil pour modifier des souches deE. coli et de Klebsiella pneumoniae qui peut provoquer une pneumonie. Cela suggère que le système d’édition peut être adapté pour cibler différentes souches et espèces de bactéries.

Selon Chase Beisel, ingénieur chimiste à l’Institut Helmholtz de Würzburg, en Allemagne, ce système d’édition de base représente un « Des progrès décisifs « dans le développement d’outils permettant de modifier les bactéries directement à l’intérieur de l’intestin. Cette étude » ouvre la possibilité de modifier les microbes pour lutter contre les maladies, tout en empêchant la propagation de l’ADN modifié “, il croit.

Les scientifiques vont désormais développer des modèles murins de maladies liées au microbiome pour déterminer si des changements génétiques spécifiques peuvent avoir un effet bénéfique sur leur santé.

[1] Brödel, AK, Charpenay, LH, Galtier, M. et coll. Édition ciblée in situ de bases bactériennes dans l’intestin de la souris. Nature (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07681-w

Source : Nature, Gemma Conroy (10/07/2024)

 
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