Le microbiote de l’omble chevalier au microscope

Le microbiote de l’omble chevalier au microscope
Descriptive text here

Ce contenu est produit par l’Université Laval.

Originaire de France, Flora Amill n’aurait jamais pensé avoir l’opportunité de travailler dans l’Arctique. Cette doctorante en biologie à la Faculté des sciences et de génie a étudié le microbiote de l’omble chevalier, un poisson important pour les communautés nordiques.

« J’ai toujours été intéressé par les micro-organismes, alors quand j’ai entendu parler du projet, j’étais motivé ! C’était une chance de pouvoir partir dans le Nord pendant mes études. Je savais que ça allait être une belle expérience », raconte Flora Amill, dont le projet s’inscrit dans le cadre du programme Sentinelle Nord.

Elle a passé deux semaines à la station de recherche de Cambridge Bay, au Nunavut, en 2018, puis de nouveau en 2019. « J’y étais pendant l’été, donc les conditions n’étaient pas aussi rigoureuses qu’en hiver. J’ai connu la toundra et des températures autour de 0℃, et non la neige avec -40℃, rassure-t-elle. Ce qui était impressionnant, c’est qu’il faisait jour presque tout le temps. Sur place, elle avait accès à un appartement et à un laboratoire pour étudier les poissons, un « réconfort » ajoute-t-elle.

Une expérience enrichissante

Lors de ses deux séjours, elle a eu la chance de collaborer avec Milla Rautio, professeure à l’Université du Québec à Chicoutimi et membre du Centre d’études nordiques, et son équipe. « Je n’avais aucune expérience en préparation de terrain, alors elle m’a montré les ficelles du métier et m’a mis en contact avec des pêcheurs et des scientifiques inuits sur place », rapporte la doctorante.

Le fait qu’elle soit novice n’a pas échappé aux pêcheurs. « Il était évident que je n’y étais pas habitué. Je n’avais jamais pêché. Ils se sont un peu moqués de moi, dit-elle en souriant. Nous avons peu parlé, mais nous avons échangé des rires. J’ai appris en faisant.

La communauté a été très accueillante. La jeune chercheuse se souvient d’un guide qui l’accompagnait, sa collègue et elle-même, jusqu’à un lac pour les protéger des grizzlis. « Il nous racontait des histoires et nous invitait à prendre un verre avec lui et sa femme. Nous avons partagé de très bons moments avec le couple inuit.

Lors d’une journée typique, Flora Amill installait les filets dans le lac avec un zodiac, puis récupérait les poissons quelques heures plus tard. A bord du bateau, elle disposait de glacières pour conserver les spécimens jusqu’au laboratoire. « Nous les avons rapidement amenés au commissariat pour une dissection. Cette étape durait très longtemps, parfois même jusqu’au petit matin. Nous avons pris un peu de tout pour nos analyses : les branchies, les intestins, les nageoires adipeuses. Quant à la chair, elle était restituée aux Inuits. Rien n’a été perdu.

Des résultats utiles aux communautés

Dans le cadre de son projet doctoral, elle a caractérisé le microbiote branchial de différentes communautés d’ombles chevaliers. L’objectif était de trouver les bactéries prédominantes et de caractériser le microbiote en fonction des conditions environnementales et de la génétique des poissons. « Nous avons observé une influence de la température et de la salinité. Nous avons également constaté une corrélation avec la présence de mercure dans l’eau », explique Flora Amill.

Pourquoi étudier le microbiote branchial ? « Les poissons possèdent trois microbiotes, celui de la peau, de l’intestin et des branchies. Les deux premiers sont assez bien étudiés, mais la recherche sur les branchies ne fait que commencer. Cependant, c’est un organe essentiel chez les poissons puisqu’il assure la respiration, mais aussi les processus d’osmo- et d’ionorégulation, essentiels chez les poissons qui migrent des eaux douces vers les eaux salées du littoral. pour se nourrir. Enfin, il est en contact direct avec l’environnement et filtre les contaminants et pathogènes de l’eau », explique Flora Amill.

Les bactéries qui composent le microbiote sont des indicateurs de la santé des poissons. Ils peuvent être bénéfiques ou, dans le cas de bactéries pathogènes, provoquer des maladies. Normalement, il existe un équilibre qui permet aux bactéries bénéfiques de protéger les poissons des agents pathogènes. « Lorsqu’il y a un déséquilibre provoqué par un stress, comme des modifications physico-chimiques de l’eau provoquées par les activités humaines ou le changement climatique, les poissons peuvent tomber malades et mourir, ce qui pourrait entraîner un déclin de la population », souligne le doctorant. Comme ce poisson fait partie intégrante de l’alimentation des Inuits, une perte affecterait les communautés.

La doctorante a publié les résultats de ses recherches dans la revue scientifique Microbiology Spectrum et termine actuellement la rédaction de sa thèse.

Après ses études, elle aimerait travailler comme biologiste pour des projets de protection des terres et des ressources dans le Nord auprès des premiers peuples.

« J’ai entendu des communautés du Nord dire qu’elles ne pêchaient plus les mêmes poissons et n’entendaient plus les mêmes oiseaux. Le paysage change et c’est un peu effrayant. Je veux contribuer à améliorer les choses, investir pour contrer ces changements importants en écoutant l’expertise des populations locales qui connaissent mieux que quiconque leur territoire. Il y a beaucoup à faire.”

 
For Latest Updates Follow us on Google News
 

PREV La Moselle et le Bas-Rhin restent en vigilance orange, mais la décrue est « bien avancée »
NEXT Européennes : Bardella lance le compte à rebours vers une victoire annoncée à Perpignan : Actualités