Quelques cellules buccales pour prédire le risque de décès

Nous ne vieillissons pas tous au même rythme, mais nos tissus vieillissent tous simultanément. En cause, les processus biologiques du vieillissement, mais aussi une multitude de facteurs comportementaux et de mode de vie déjà connus pour accélérer le vieillissement, notamment le stress, le manque de sommeil, une mauvaise alimentation, le tabagisme et l’alcool. Alors que ces facteurs environnementaux impriment leur signature sur notre génome sous forme de marques épigénétiques, il devient possible, avec ces nouvelles horloges épigénétiques, de quantifier le vieillissement moléculaire en caractérisant l’épigénome au niveau de sites génomiques pronostiques.

Plusieurs « horloges épigénétiques » ont été développéesaxé sur la méthylation de l’ADN dans cellules sanguinesrendant le prélèvement d’échantillons fastidieux et stressant pour le patient. Cette horloge de deuxième génération, appelée « CheekAge », utilise des données de méthylation cellulaire plus faciles à collecter.

« CheekAge » utilise des cellules collectées à l’intérieur des joues !

L’étude menée par une équipe new-yorkaise confirme la capacité de CheekAge à prédire avec précision le risque de décès à partir des cellules de la joue – mais aussi à partir des données épigénétiques d’un autre tissu. En revanche, les scientifiques confirment que la sélection de sites de méthylation spécifiques est particulièrement importante pour cette prédiction ;

« qui révèle également des liens entre certains gènes et des processus spécifiques de vieillissement et de mortalité »ajoute l’un des auteurs principaux, le Dr Maxim Shokhirev.

Ainsi, la recherche révèle des gènes cibles comme PDZRN4, un possible suppresseur de tumeur, et ALPK2, déjà impliqués dans le cancer et la santé cardiaque, qui pourraient être candidats pour réduire le risque de maladies liées à l’âge.

JoueÂge a été nourri et perfectionné à l’aide des données de méthylation provenant de plus de 200 000 sites, comparées à un score global de santé et de mode de vie. La validation de sa capacité prédictive a été réalisée auprès de 1 513 participants, femmes et hommes, nés en 1921 et 1936 et suivis tout au long de leur vie par les Lothian Birth Cohorts de l’Université d’Edimbourg. Dans le cadre de cette cohorte, le méthylome des participants a été analysé tous les 3 ans, dans les cellules sanguines et sur environ 450 000 sites de méthylation de l’ADN. L’analyse confirme que :

• CheekAge surpasse les horloges de première génération formées sur des ensembles de données de cellules sanguines ;
• pour chaque augmentation de l’écart type de CheekAge, le rapport de risque de mortalité toutes causes confondues augmente de 21 % ;

• en d’autres termes, CheekAge est fortement associé au risque de mortalité chez les personnes âgées ;

• Les résultats de CheekAge, cohérents avec ceux d’autres horloges épigénétiques basées sur les données des cellules sanguines, suggèrent qu’il existe effectivement des signaux de mortalité épigénétique communs à tous les tissus.

La simple collecte de cellules de la joue, non invasive, constitue donc une alternative prometteuse pour étudier la biologie du vieillissement plus simplement et probablement sur des échantillons plus importants.