Dans le cadre de l’appel à projets Welbio Investigator Program, deux projets du FARAH et un autre du GIGA ont été sélectionnés pour bénéficier d’un financement à l’Université de Liège.
Grâce à ce financement, la Wallonie apporte sur plusieurs années des moyens importants aux chercheurs WELBIO au sein de l’Institut de Recherche WEL pour leur permettre de développer des programmes de recherche ambitieux et ainsi réaliser de nouvelles avancées scientifiques. Les chercheurs du WEL Research Institute doivent démontrer leur excellence scientifique, leur connaissance des besoins médicaux et technologiques dans leur domaine et leur volonté de rechercher des opportunités d’application pour leurs découvertes.
Dans le cadre de l’appel 2023, 3 projets ont été sélectionnés à l’ULiège.
Les infections à pneumovirus induisent des altérations durables de l’immunité de l’hôte, favorisant le développement de cancers du poumon | Subvention de démarrage
Bénédicte Machiels, Faculté de Médecine Vétérinaire, FARAH – Santé Publique Vétérinaire, Département des Maladies Infectieuses et Parasitaires (DMI)
Les facteurs environnementaux influencent le développement de maladies, notamment les cancers. Les virus respiratoires sont très répandus et potentiellement responsables d’altérations durables de l’immunité de l’hôte. Cependant, l’impact de ces changements sur l’immunité anti-tumorale est peu étudié. Le virus respiratoire syncytial humain (VRS), pneumovirus responsable de bronchiolites chez les enfants et d’infections à répétition chez les personnes âgées, intrigue. Bien qu’il provoque une infection passagère, ce virus est associé au développement d’immunopathologies de type 2 plus tard dans la vie, suggérant une empreinte immunitaire à long terme. Ce projet vise à étudier si et comment l’empreinte immunitaire induite par un pneumovirus peut affecter l’immunité anti-tumorale. Pour cela, nous utiliserons le virus de la pneumonie de la souris (PVM), homologue du RSV, et plusieurs modèles de tumeurs (cellules de carcinome du poumon de Lewis ainsi qu’un modèle de développement spontané de tumeurs pulmonaires). Dans un premier temps, nous testerons ces modèles chez la souris afin de caractériser d’un point de vue clinique et histologique l’impact d’une préinfection par PVM sur l’immunité anti-tumorale. Ensuite, nous utiliserons la cytométrie en flux, le séquençage d’ARNc, l’imagerie et la cartographie spatiale pour définir les changements cellulaires et moléculaires associés à la PVM suite à l’implantation d’une tumeur. Nous étudierons également les mécanismes sous-jacents à travers des approches in vivo telles que l’utilisation de souris KO conditionnelles, les déplétions, les transferts adoptifs ainsi que les analyses épigénétiques sur les progéniteurs myéloïdes. Enfin, des stratégies de prévention ou de correction de l’empreinte délétère due à la PVM seront testées dans des modèles précliniques. Ces recherches pourraient révéler les effets immunomodulateurs des pneumovirus favorisant le développement de cancers et identifier des cibles prophylactiques/thérapeutiques innovantes.
Reprogrammation de la synthèse protéique via des modifications chimiques des ARN de transfert dans les pathologies humaines | Bourse avancée
Alain Chariot, Faculté de médecine, GIGA Cellules souches – Chimie médicale
La reprogrammation des protéines permet aux cellules cancéreuses de proliférer et de survivre plus longtemps. De nombreuses pathologies humaines se caractérisent par une dérégulation de cette reprogrammation. Les modifications chimiques des ARN de transfert régulent la traduction des ARN messagers et jouent donc un rôle important dans la reprogrammation des protéines. L’enzyme Elp3 modifie certains ARN de transfert et est impliquée dans le développement tumoral et la progression métastatique. La perte de fonction d’Elp3 dans les hépatocytes entraîne une mortalité postnatale via le blocage de la production de glucose. Nous définirons les mécanismes par lesquels Elp3 favorise la différenciation cellulaire dans le foie. Nous identifierons de nouvelles cibles dont la traduction implique Elp3. De plus, la perte de la fonction Elp3 dans les adipocytes exacerbe la prise de poids suite à un régime riche en graisses. Nous identifierons les acteurs moléculaires impliqués dans l’hypertrophie adipocytaire et dont la traduction est régulée par Elp3. Enfin, nous déterminerons si la perte de la fonction Elp3 dans les adipocytes sensibilise les souris au cancer du foie lié à l’obésité. Enfin, nous explorerons également le rôle de Lepre-1, une hydroxylase qui cible les résidus proline, dans le développement des tumeurs de l’intestin. Nos travaux apporteront de nouvelles réponses sur la manière dont les modifications chimiques des ARN de transfert régulent la biologie des hépatocytes et des adipocytes avec des conséquences importantes en termes de métabolisme hépatique, d’obésité et de cancer du foie lié à l’obésité. Notre projet nous permettra également d’établir une signature de prolines hydroxylées par Lepre-1 lors du développement tumoral.
Identification des mécanismes régulant les fonctions effectrices des lymphocytes T à mémoire virtuelle lors de co-infections helminthiques et virales | Bourse avancée
Benjamin G. DEWALS, FARAH : Santé Publique Vétérinaire, Département des Maladies Infectieuses et Parasitaires (DMI)
Certains lymphocytes T CD8+, définis comme « mémoire virtuelle » (VmT), se développent rapidement après stimulation par l’interleukine (IL)-4, une cytokine de type 2 impliquée dans l’immunité antihelminthique et la réponse allergique. Bien que les cytokines de type 2 inhibent généralement l’immunité de type 1 associée à l’immunité antivirale, les Tvm stimulées par l’IL-4 conservent une signature IFN de type I et produisent des molécules effectrices antivirales. L’activité synergique de l’immunité de type 1 et 2 dans la fonction des cellules Tvm représente un changement de paradigme dans notre compréhension de la défense de l’hôte, offrant l’occasion d’analyser la façon dont des voies immunitaires disparates convergent pour former épigénétiquement une immunité protectrice. Comprendre les mécanismes qui contrôlent la fonction des cellules Tvm est essentiel pour améliorer une protection rapide contre divers agents pathogènes. Cependant, des questions restent en suspens : par exemple, comment les cellules Tvm sont-elles uniquement empreintes d’IL-4 et quelle est la longévité de cette empreinte ? Comment les cellules Tvm autoréactives sont-elles régulées ? Pouvons-nous exploiter les réponses Tvm chez des espèces autres que les souris, comme les humains ou d’autres espèces animales d’importance vétérinaire ? Pour combler ces lacunes, il existe un besoin urgent de combiner des modèles animaux précliniques d’infections avec des approches bioinformatiques pour révéler les réseaux moléculaires complexes qui sous-tendent le fonctionnement des cellules Tvm. Ici, nous poursuivrons trois objectifs principaux pour identifier les mécanismes fondamentaux qui régulent les réponses des cellules Tvm et qui peuvent être exploités pour la prochaine génération d’interventions visant à manipuler les réponses aux infections par les cellules T.
Félicitations à eux !
Welbio
L’Institut de Recherche WEL est un institut de recherche interuniversitaire basé en Wallonie dont la mission est de soutenir la recherche stratégique d’excellence. Son département WELBIO finance des programmes de recherche dans les domaines des sciences du vivant, et favorise la valorisation des résultats scientifiques dans les applications médicales, pharmaceutiques et biotechnologiques vétérinaires.
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